Nasze publikacje

Baranykova S., Gupta R. K., Kajdasz A., Wasilewska I., Macias M., Szybinska A., Węgierski T., Nahia K. A., Mondal S. S., Winata C. L., Kuźnicki J., Majewski Ł. (2024). Loss of Stim2 in zebrafish induces glaucoma-like phenotype. Scientific Reports, 14: 74909. DOI: 10.1038/s41598-024-74909-0

Przejdź do publikacji:
https://www.nature.com/articles/s41598-024-74909-0

Salachna P., Wesołowska A., Zawadzińska A., Kańczurzewska M., Sawikowska A., Darras A., Neugebauerová J., Meller E., Pietrak A., Piechocki R., Łopusiewicz Ł. (2024). Flaxseed oil cake improves basil (Ocimum basilicum L.) yield under drought stress by increasing herb biomass and quality of essential oil. Industrial Crops & Products 220: 119295. DOI: 10.1016/j.indcrop.2024.119295

Przejdź do publikacji:
https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2024.119295

Sawikowska A. (2020). Meta-analysis of flavonoids with antiviral potential against coronavirus. Biometrical Letters 57: 13-22. DOI: 10.2478/bile-2020-0002

Przejdź do publikacji:
https://sciendo.com/article/10.2478/bile-2020-0002

Opis publikacji:

Loss of Stim2 in zebrafish induces a glaucoma-like phenotype.

W badaniu zbadano rolę białka Stim2 w układzie wzrokowym danio pręgowanego, ze szczególnym uwzględnieniem jego wpływu na sygnalizację wapniową w siatkówce oraz potencjalny związek z jaskrą. Zastosowano różne metody bioinformatyczne, w tym sekwencjonowanie RNA oraz sekwencjonowanie RNA na poziomie pojedynczych komórek, aby zbadać zmiany w ekspresji genów i składzie komórkowym u ryb pozbawionych genu stim2. Kluczowe wyniki obejmują zmniejszenie liczby komórek zwojowych siatkówki, ścieńczenie warstw siatkówki oraz zmiany w neuronach GABAergicznych, co stanowi charakterystyczne cechy jaskry. Badanie podkreśla znaczenie stim2 w utrzymaniu homeostazy wapniowej i jego potencjalną rolę w neurodegeneracji siatkówki. Do analiz bioinformatycznych należały: wstępne procesowanie danych pochodzących z sekwencjonowania RNA w pojedynczych komórkach (single cell RNA-Seq); wyznaczenie clustrów komórek i oznaczenie ich ze względu na ekspresję genów markerowych; analiza ekspresji różnicowej genów w obrębie clustrów oraz analiza ich funkcji (ontologia genów); obliczenie stosunku ilości komórek w modelu stim2-KO w porównaniu do typu dzikiego.

Flaxseed oil cake improves basil (Ocimum basilicum L.) yield under drought stress by increasing herb biomass and quality of essential oil.

Nasze badania dotyczą wpływu stresu suszy na bazylię, odkrywając kluczowe mechanizmy adaptacyjne rośliny oraz podkreślając korzystną rolę wytłoków z oleju lnianego (FOC) w łagodzeniu skutków tego stresu. Nasz wkład w publikację obejmuje analizę statystyczną wraz z analizą sieci korelacyjnych. Kluczowe wnioski obejmują zmniejszone plony i zmodyfikowany skład olejku eterycznego w wyniku stresu suszy, przy czym zastosowanie FOC wpływało na zawartość wyspecjalizowanych metabolitów roślinnych. Co istotne, w warunkach suszy FOC poprawiał biomasę roślin oraz zwiększał akumulację linalolu i metyloeugenolu. Badanie podkreśla również podwyższony poziom azotu w tkankach roślinnych i podłożach, a także identyfikuje świeżą masę, suchą masę oraz metyloeugenol jako „huby”, czyli cechy skorelowane z większością innych cech. Do analizy danych zastosowano dwuczynnikową analizę wariancji (ANOVA), analizę głównych składowych (PCA) oraz sieci korelacyjne.

Meta-analysis of flavonoids with antiviral potential against coronavirus.

Prezentujemy Państwu wyniki naszej pracy na temat koronawirusa SARS-CoV-2. Jest to metaanaliza flawonoidów mających potencjał w zwalczaniu koronawirusa. Przeanalizowaliśmy wyniki badań naukowych na temat kluczowych metabolitów neutralizujących koronawirusa: roifoliny, pektolinaryny, herbacetyny. W niniejszej publikacji skupiamy się na wskazaniu najlepszych źródeł do pozyskania tych metabolitów. Nasze badania mogą przysłużyć się skutecznemu wyizolowaniu powyższych związków w celu uzyskania leków.